毛巾的使用非常頻繁，毛巾上常常沾染有人體分泌物，這其中就有許多的致病性微生物，如沙眼衣原體、金黃色葡萄球菌、淋球菌及霉菌等，因此，應每星期消毒。消毒方法有以下幾種：蒸煮消毒法，把毛巾先用開水煮沸10分鐘左右，然后再用肥皂水清洗，晾干后就可以使用了.
1、微波消毒法，將毛巾清洗干凈，折疊好后放在微波爐中，運行5分鐘就可以達到消毒目的。
2、高壓蒸氣消毒法，將毛巾放入高壓鍋中，加熱保持30分鐘左右，就可以殺滅絕大多數微生物。
3、化學消毒劑消毒法，消毒劑可以選擇稀釋200倍的清洗消毒劑或0.1％的洗必泰。將毛巾浸泡在上述溶液中15分鐘以上，然后取出毛巾用清水漂洗，將殘余的消毒劑去除干凈，晾干后就可以再次放心地使用了。
4、毛巾變硬主要是水中游離的鈣、鎂離子與肥皂結合，生成鈣鎂皂粘附在毛巾上而造成的，長時間的污垢殘留積累也是變硬的一個原因。要使其變軟，可以在1.5千克水中加30克純堿或適當柔軟劑煮10分鐘即可。
5、將毛巾用手搓洗干凈后放入開水中（沒過毛巾即可），撒5克鹽，浸泡5<分鐘取出，再次用清水搓洗干凈，懸掛在通風干燥處晾曬，有條件的話，在陽光下暴曬效果最好。
6、將毛巾用手搓洗干凈后放入開水中（沒過毛巾即可），滴入10ml白醋，浸泡5分鐘取出，再次用清水搓洗干凈，懸掛在通風干燥處晾曬，有條件的話，在陽光下暴曬效果最好。